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15 Sep 2025
ポッドキャスト新エピソードです！
理研でPIをされている荻沼政之先生をゲストに、pHや解糖系の勾配による発生タイミングの制御、キリフィッシュを用いた休眠研究、遺伝研でのPhD生活からフランス/アメリカにわたるポスドク生活、これからの展望についてお聞きしました
open.spotify.com/episode/60o…
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RNAの局在を決めるルールに迫る
大規模並列レポーターアッセイにより哺乳類の細胞でRNAの局在を制御するエレメントを探索。厳密に配列が重要な必須エレメントと、全体の塩基組成が重要な支持エレメントを発見。軸索へのRNA輸送などに貢献
重要そうです、、
biorxiv.org/content/10.64898…
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核内の細胞骨格因子による幹細胞運命制御
プロテオミクス解析により、通常細胞質に存在する細胞骨格タンパク質が神経幹細胞の核内に存在することを発見。クロマチン因子と相互作用することで、幹細胞運命を制御するらしい。神経発達疾患との関連も
cell.com/cell/fulltext/S0092…
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細胞核-ミト相互作用によるエネルギー制御
ミトコンドリアがテザリング因子RANBP2とVDAC1を介して、核膜孔と物理的に結合することを発見。ATPやホスホクレアチン等の分子の核内輸送に貢献し、この相互作用の阻害でヒストン修飾や細胞分化に影響がでる
核-ミトも相互作用！
nature.com/articles/s41586-0…
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がん細胞を選択的に除去する新手法
Cas12a2を用いることで、がん細胞特有の変異mRNAを認識した際に細胞内のクロマチンを裁断し細胞を死滅させる手法を確立。従来の薬剤で標的困難であった遺伝子編員を持つ細胞を高い精度で識別可能
nature.com/articles/s41586-0…
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mRNAの非翻訳領域がシャペロンとして働くかも
保存された配列を持つ3'UTRが、天然変性領域を持つタンパク質の凝集などを防ぎ、活性を維持するために重要であることを発見。3'UTRが欠損するとタンパク質が適切に折り畳まれず、量や局在は変わらず活性が減少
驚きです、、
cell.com/cell/fulltext/S0092…
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リソソーム修復を司る新因子LASER
損傷したリソソームの修復に関わる因子として、ゲノムワイドスクリーニングからLASER複合体を同定。リソソーム損傷を検知して膜修復因子をリクルートするらしい。神経変性疾患とも関連するらしい
nature.com/articles/s41586-0…
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脂肪滴が抗ウイルス応答のハブに
従来脂質の貯蔵庫とされていた脂肪滴が、抗ウイルス応答に貢献することを報告。ウイルス感染時に抗ウイルス因子が脂肪的表面に集積し、ミトコンと接触することで免疫シグナル伝達を促進するらしい
脂肪滴にそんな機能も
nature.com/articles/s41467-0…
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エンハンサーRNAからタンパク質ができる？
エンハンサーRNAは長く非コードRNAと思われいたが、その一部がタンパク質へと翻訳されること、それらがde novo(新規)遺伝子誕生に関わる可能性を報告。アルギニンに富み、細胞核内に多いとか
エンハンサーからもタンパク質が、
cell.com/trends/genetics/ful…
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深層学習による相分離凝集体の解析
顕微鏡画像から核小体や核スペックルなどの凝集体の特徴を抽出する技術Deep-Phaseを確立。核小体が花のようになるフラワー型構造やその形成機序を発見。rRNAの形成と成熟のバランスが重要らしい
cell.com/cell/fulltext/S0092…
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爆発的細胞死「ラプトーシス」
プラナリアで、細胞が爆発する細胞死を起こし、周囲の細胞を死滅させる免疫系として働くことを発見。分泌細胞由来の細胞によって担われ、進化の初期から存在する生体防御機構である可能性。ホルモンによって制御されるらしい
cell.com/cell/fulltext/S0092…
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超並列の生化学解析を可能する新手法(APB-Display)
ハイドロゲルビーズに目的のタンパク質を発現させ、FACSとNGSと組み合わせることで、数万以上のタンパク質親和性を一気に解析することを可能に。タンパク質の配列と機能の相関を予測するための機械学習モデルの構築へ
biorxiv.org/content/10.64898…
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即時型老化細胞による傷の修復
組織損傷後に、転写に依存せず翻訳ですばやく制御される即時型の老化細胞が存在することを発見。この細胞は炎症性因子や細胞移動を促す因子を放出し、組織の再上皮化と再生を促進するらしい
翻訳での制御というのも面白いです
nature.com/articles/s41556-0…
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髄膜は意外に多機能
髄膜の発生過程をシングルセル解析で明らかに。髄膜と脳の神経系は相互作用しながら発達し、例えば軟膜の線維芽細胞が免疫細胞の配置に貢献したり、TREM2陽性のマクロファージが神経細胞の発生を制御したりするらしい
cell.com/cell/fulltext/S0092…
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オルガネラ相互作用と老化
これまでリソソームの酸性化は細胞質のプロトンの取り込みによると思われていたが、今回ミトコンの電子伝達系が供給源になることを発見。細胞老化によりリソ-ミト相互作用が減少し、リソソーム酸性度が低下、機能不全に
おもしろいです、
cell.com/molecular-cell/full…
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IRESの改良による翻訳制御へ
キャップ非依存で翻訳を開始するIRESはEMCVというウイルスのものがスタンダードだが、今回マルチプレックス解析などにより、より高い活性や組織特異性をもつIRESを同定。さらにAIモデルを組み合わせ、二次構造などの特性を解明
biorxiv.org/content/10.64898…
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肝臓マクロファージによる磁気の感知
ハトが肝臓にあるマクロファージによって磁気を感知することを発見。代謝過程で鉄分を蓄積しており磁気受容可能とか。これがないと曇天時に方位を見失ってしまうらしい。視覚や嘴の器官に依存しない新規ナビゲーション機構
驚きです、
science.org/doi/10.1126/scie…
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細胞内凝集体による水ポテンシャルの感知
植物細胞が水不足を感知して適応する仕組みとして、SAM8というタンパク質が水ポテンシャルを感知して凝集状態を変化させることを発見。凝集したSAM8は特定の因子を核内に留めることで、ストレス環境での生存に貢献するらしい
nature.com/articles/s41586-0…
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生体内での単一細胞翻訳解析
技術的工夫を行うことで、生体組織から単一細胞リボソームプロファイリングを行う手法を確立。老化した表皮幹細胞ではRNA量と翻訳量にデカップリングがみられたり、非標準の翻訳がおきたりするらしい
cell.com/molecular-cell/full…
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組織の硬さによる発生の制御
初期胚発生において、組織の硬さとモルフォゲン勾配にフィードバック機構があることを発見。モルフォゲンであるNodalは組織の合成を高め、これによりNodal自体の拡散を抑制、さらに拮抗因子の発現を促進
面白いフィードバックです
nature.com/articles/s41556-0…
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天然変性領域の機能に迫る
(配列自身ではなく)アミノ酸配列の物理化学的特性やモチーフに基づいて分類することで、天然変性領域の機能予測を実現。相分離への関与等だけでなく、がんや自閉症といった疾患への関連も
まだまだ謎が多いですね
pnas.org/doi/10.1073/pnas.26…
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