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Ichihashi Lab Komaba @KomabaLab

東大市橋研のニュース等を流します

Joined January 2019
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この前卒業した宮地さんの最後の論文がでました。 In vitroでアミノ酸(A, L, S)の配置を色々変えた非標準遺伝暗号表を10種類作って、変異に対する頑強性を調べたところ、どれもあまり変わりませんでした。 elifesciences.org/reviewed-p… プレスリリースもしました。 c.u-tokyo.ac.jp/info/news/to…

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この前卒業したD3湯川さんの論文がオープンになりました。プレスリリースもしました。自己複製RNAを高頻度希釈環境で長期継代したら、絶滅へ向かう進化がおきました。進化すればいいってものではないようです。 c.u-tokyo.ac.jp/info/news/to… academic.oup.com/mbe/article…
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この前卒業した宮地さんのtRNA array法version 2の論文が出ました。以前、報告した一気に21種類のtRNAを合成する方法を改良して、複数のタンパク質の発現量を個別にin vitro調整したtRNAを使ったときと同レベルまで上げました。以下のリンクから50日は無料で読めるそうです。authors.elsevier.com/a/1m~…
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次回4月5日（日）のNHKサイエンスゼロで、私たちの研究を紹介してもらえるようです。多分、市橋が登場します。web.nhk/tv/an/zero/pl/series…

生命とは何か?40億年の謎に挑む | サイエンスZERO

【NHK】生命とは何か？４０億年の謎に挑む！▼生命を知るために研究者が「人工生命」を生んだ！？明らかになった「生命の定義」とは？▼生命誕生を再現？！非生命から生命はどうやって生まれたのか？▼４０億年前の共通祖先とはどんな生命？そこから見えてきた「生命誕生のシナリオ」とは？▼生命科学から哲学へ、最新研究から生まれた研究者たちの「新たな生命観」

web.nhk
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今日から開催の生命の起源とアストロバイオロジー学会で2名が発表します。 S2-O6： 植田 悠斗　進化実験における自己複製 RNA と寄生型 RNA の融合 P-2A： 山本 風路　自己複製RNA の進化実験における組み換え体の出現
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学部4年の高槻さんが卒業されました。さらに一高賞も授与されました。おめでとうございます！
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今年は4名が修士の学位を取得しました。渡邊さん、櫻井さん、植田さん、折居さん、おめでとうございます！　うち2名（櫻井さん、植田さん）は研究奨励賞も受賞しました！
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宮地さんが博士の学位を取得しました。おめでとうございます！　恒例のこまっけろをプレゼントしました。
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特任助教の金井さんが「ゲノム微生物学会若手賞」、B4の高槻さんが「ゲノム微生物学会最優秀ポスター賞」を受賞しました。おめでとうございます！
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もうすぐ卒業する宮地さんの論文をbioRxivに上げました。in vitroで遺伝暗号表をできるだけ変えまくって、変異に対する頑強性を比較したところ、全然変わりませんでした。 biorxiv.org/content/10.64898…
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M1の山本風路さんが、先日行われたMASSIV 1.0 においてTop Poster Awardを受賞しました！　おめでとうございます。program.massivconference.com…

MASSIV Program

program.massivconference.com
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宮地さんの論文をbioRxivにあげました。昨年に発表した21種類のtRNAを全部一度に作る方法(tRNA array method)を改良して、複数のタンパク質について個別精製されたtRNAと同レベルの翻訳活性を達成しました。biorxiv.org/content/10.64898…

Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs

Transfer RNAs (tRNAs) play an essential role in translation, and their simultaneous in vitro synthesis remains a key challenge in bottom-up synthetic biology. We previously developed the tRNA array...

biorxiv.org
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分子生物学会で金井さんと宮地さんが発表します（した）。 金井さん　[2P-171]自己複製RNAの進化実験における寄生種と分子種の多様化の関係 宮地さん　[3P-002]tRNA array法による21種類のtRNAのin vitro同時発現
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あと市橋もTwistのランチョンセミナーに出現します [3BT-03-01]自分で自分を作る（増殖する）分子システムの実現に向けて現状と課題
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D3の宮地さんがCREST領域会議で最優秀ポスター発表賞をもらってました。すごい！
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D3　宮地さんが生物物理学会の学生発表賞を受賞しました！　おめでとうございます！
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あと市橋は野地さんとシンポジウムをやります。 2SKP 人工細胞そして生命ー非生命の境界 そこで口頭発表もします。 2SKP-5 生物みたいに自己再生産できる人工システムを作りたい：現状と展望
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今週の生物物理学会で3名発表します。 1GJ001 宮地さん tRNA array 法による21 種類のtRNA のin vitro 同時発現 1Pos154 庄司さん 翻訳因子の持続的な再生産によるin vitro 自己増殖系の構築 2Pos150 櫻井さん PURE system 内における翻訳阻害効果の解消
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B4の高槻さんが遺伝学会の2025年度Young Best Poster賞をいただいたようです。おめでとうございます！gsj3.org/newslist/2025/news3…
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明日からの細胞を「創る」研究会で当研究室から７名が発表します。 櫻井さん「PURE systemにおける翻訳阻害効果」 庄司さん「翻訳因子の持続的な再生産によるin vitro自律増殖系の開発」 山本さん「自動継代ロボットを用いた自己複製RNAの長期進化実験」 ー続く　(1/3)
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宮地さん「セントラルドグマ自己再生産を支えるtRNA自律合成系の構築 ―tRNA array法の確立と改良―」 折居さん「PUREシステムにおいて発現量に影響を与える遺伝子配列の定量的評価」 金井さん「寄生種はQβ Replicaseの多様化を促進するだろうか？」 ー続く (2/3)
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高槻さん「23SrRNA の修飾酵素遺伝子をすべて欠損した大腸菌の作出とそのサプレッサー変異の同定および16SrRNAの修飾酵素遺伝子の欠損」 植田さん「原始的な複製体の進化実験における複製体と寄生体の融合」
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