Ah ahora sí, la solución que estábamos esperando

🕵🧬🖥 How to computationally discover protein functions? Just released 🔥 Our latest annotation model for domains in Pfam! 📣 ET-Pfam: an ensemble of deep models with transfer learning, now published in Bioinformatics @OxfordJournals

Ayer desayunamos con la noticia de que Paul habia encontrado la "cura milagrosa" al mastocitoma de su perra Rosie con USD 3000 y usando ChatGPT/AlphaFold. Pero, ¿esto realmente es así? Les comparto mi análisis, junto a una introducción del resto los protagonistas de esta historia.

Recién depositado mi sueldo de docente universitario de Febrero. Cargo simple, 40 hs/mes. Me pagan $4570 la hora. Pero no tenemos que hacer paro porque los estudiantes 👍

🕵🧬🖥 How to computationally annotate protein domains in Pfam? Check out our new paper! 📣 Introducing GNN2Pfam: a new model based on Graph Neural Networks, published in @JStructBiol

Enero aun no terminó y se siente exactamente asi y esto es de lo que quiero hablar, mes a mes esto va a ir creciendo exponencialmente, por que? Porque programar herramientas requiere cada vez menos tiempo entonces mes a mes van a aparecer cada vez mas herramientas las cuales van a ser hypeadas hasta la muerte. Lo importante de esto es saber separar, dejen de darle bookmark a todo si ustedes mismos saben que no lo van a leer, no se mientan, no se sobrecarguen por querer aprender las 120 herramientas vibecodeadas que salen por dia, investiguen las que realmente les interese y no se estresen al pedo.

Mande 3 diseños que se expresaron aunque no resultaron buenos binders, es un montón lo que se puede hacer con boltz gen y optimización bayesiana

El gordo magnético la vio, tenían razón todos vamos a morir ?)

We were promised programmable biology but we got indecipherable programming instead

Hello World 👋 Today we are unveiling Boltz PBC, a Public Benefit Corporation to advance AI for biology through open science, and make it accessible to every scientist building a healthier future. Follow to stay up to date, and read more on our manifesto: boltz.bio/manifesto

El momento del año para

I've never felt this much behind as a programmer. The profession is being dramatically refactored as the bits contributed by the programmer are increasingly sparse and between. I have a sense that I could be 10X more powerful if I just properly string together what has become available over the last ~year and a failure to claim the boost feels decidedly like skill issue. There's a new programmable layer of abstraction to master (in addition to the usual layers below) involving agents, subagents, their prompts, contexts, memory, modes, permissions, tools, plugins, skills, hooks, MCP, LSP, slash commands, workflows, IDE integrations, and a need to build an all-encompassing mental model for strengths and pitfalls of fundamentally stochastic, fallible, unintelligible and changing entities suddenly intermingled with what used to be good old fashioned engineering. Clearly some powerful alien tool was handed around except it comes with no manual and everyone has to figure out how to hold it and operate it, while the resulting magnitude 9 earthquake is rocking the profession. Roll up your sleeves to not fall behind.

Por si no tenían temas para preocuparse 😅

Este año fue un laburazo del team bioinfo del @sinc_i, se vienen cosas interesantes!

Cáncer de piel: ya está disponible la vacuna argentina para tratar el melanoma de alto riesgo lanacion.com.ar/sociedad/can…

La historia de perseverancia de Tamara Rubilar: Su hijo tenía una enfermedad autoinmune y ella encontró la cura con erizos de mar. 🔬 #OtroDiaPerdido

AI-for-biology is becoming one of the toughest places to publish. Output in mainstream ML is exploding, but biology-focused AI moves slower—and students feel the pressure first. 1/12