生物学者。CRISPRdirect, siDirect, GGGenome 開発者。DBCLS→東京医科歯科大学（2023/4/1〜）
Joined August 2007
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Apr 1
ライフサイエンス統合データベースセンター（DBCLS）は、国立遺伝学研究所の部門になりました x.com/dbcls/status/203927070…
組織体制変更のお知らせ（2026年4月）
dbcls.rois.ac.jp/ja/2026/04/…
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Apr 1
rifff《ﾘｭﾌﾌ》すごい！ リッチテキスト対応の差分比較ツール。おすすめです。
x.com/TadashiNakai/status/20…
Mar 20
difff《ﾃﾞｭﾌﾌ》は便利なのですが、機密文書を外部に送信するのはまずいので、ローカル処理（データ送信なし）のrifff《ﾘｭﾌﾌ》を作ってみました。テキストだけでなく太字・斜体・下付き・上付きなどの書式の差分も検出できます。tools.nakaix.com/rifff/
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meso_cacase retweeted
Mar 20
difff《ﾃﾞｭﾌﾌ》は便利なのですが、機密文書を外部に送信するのはまずいので、ローカル処理（データ送信なし）のrifff《ﾘｭﾌﾌ》を作ってみました。テキストだけでなく太字・斜体・下付き・上付きなどの書式の差分も検出できます。tools.nakaix.com/rifff/
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Mar 3
GGGenomeのデータベースを更新しました：
DDBJ 139.0 (Sep, 2025)
GENCODE human 49 (Sep, 2025)
GENCODE mouse M38 (Sep, 2025)
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Mar 3
GGRNA/GGGenomeをRefSeq 233 (Jan, 2026) に更新しました。通常RefSeqはおよそ2ヶ月ごとにリリースされますが、今回は約5ヶ月ぶりでしたね。
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Database updated to RefSeq release 233 (Jan, 2026). Database update history: github.com/meso-cacase/GGGen…
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Database updated to RefSeq release 233 (Jan, 2026). GGRNA.dbcls.jp/
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9 Dec 2025
西郷先生の伝説的な試験問題。たしか @K_Miyamichi さんの代からいただいた過去問だと思います。
西郷薫先生のご冥福をお祈りいたします。
difff.jp/dev/bunshi1.html
x.com/K_Miyamichi/status/199…
8 Dec 2025
西郷先生と言えば、”角が生えた鬼について発生生物学的に考察せよ”とか1 kb以上の塩基配列をプリントして”この中から最長のORFを探せ”とか試験問題も印象的だった。ORFの問題はコドン表も与えられず目視で探す苦行、もちろん正解は相補鎖側にあった。RIP
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6 Nov 2025
テキスト比較ツール difff《ﾃﾞｭﾌﾌ》 difff.jp/ は設備のメンテナンスのため2025/11/5(水)17時～11/7(金)22時[予定]まで停止しております。
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6 Nov 2025
設備のメンテナンスにともない、2025/11/5(水)17時～11/7(金)22時[予定]の間、GGRNA / GGGenome / CRISPRdirectを含め、DBCLSの多くのサービスが停止しております。
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Database updated to RefSeq release 232 (Sep, 2025). Database update history: github.com/meso-cacase/GGGen…
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Database updated to RefSeq release 232 (Sep, 2025). GGRNA.dbcls.jp/
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Database updated to DDBJ release 138.0 (Jul, 2025). Database update history: github.com/meso-cacase/GGGen…
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8 Sep 2025
サービス再開しました！ x.com/meso_cacase/status/196…
5 Sep 2025
落雷による停電の影響で、GGRNA / GGGenome / CRISPRdirectを含め、DBCLSの多くのサービスが利用できなくなっているようです。
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5 Sep 2025
落雷による停電の影響で、テキスト比較ツール difff《ﾃﾞｭﾌﾌ》が使えないではないか。ﾆｬｰﾝも表示されない
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5 Sep 2025
落雷による停電の影響で、GGRNA / GGGenome / CRISPRdirectを含め、DBCLSの多くのサービスが利用できなくなっているようです。
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