Pure computer scientist, biology lover, IPA crafter, scientific artist, basketball passionate

Joined June 2014
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I’m really excited about our Editorial paper on Nature Methods about power analysis in spatial transcriptomics! So many thanks to @A_Sottosanti e @drisso1893 💥💥💥 nature.com/articles/s41592-0…

Check out our News & Views article on Nature Methods, where we discuss how to determine factors such as the dimension and the resolution of sampled tissue areas for optimally designing spatial omic experiments. Joint work with @drighelli and @drisso1893 rdcu.be/c6KbR
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They raped a man. They gang-raped him. They raped him so brutally that he had to be hospitalized. Doctors documented the injuries. The video of the assault was leaked. Now the rapists are free. This is not just unlawful and immoral. It is sick! #ThisIsIsrael
Mar 12
Israel dropped charges against 5 IDF soldiers who were caught on camera beating and raping a Palestinian prisoner. Follow: @AFpost
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Just to let you know that our last #package SpaceTrooper for Quality Control and dedicated plots of Imaging-based Spatial Transcriptomics data is now on @Bioconductor devel. Give it a try, and provide us any feedback/issue. bioconductor.org/packages/Sp…
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Dario Righelli retweeted
12 Jun 2025
Dario Righelli introduces SpaceTrooper at #BITS2025 An R package for QC and preprocessing of imaging-based spatial transcriptomics, integrating transcriptomic and spatial data to boost analysis quality. @drighelli
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Dario Righelli retweeted
20 Jan 2025
Recently, we held the first #scverse SpatialData 3-day hackathon in Basel (Switzerland), where we brought together 20 developers from the Python, R, and web communities to work on interoperability, performance, and ergonomics for spatial omics data. Here is what we worked on!
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My first Conference in a Church! #Bioinformatics in #Naples
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I just discovered #chatgpt4 to write #roxygen documentation of my @rstatstweet functions and there is no going back!
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Papers submissions open for “Advancements in Biological Network Analysis”, at CIBB 2024 (19th conference on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics), September 4-6, Benevento, Italy. Deadline: 15th May bioinformatics-sannio.org/ci…

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📣 Abstract submission is open for #EuroBioC2024 conference in Oxford 🇬🇧 Sep 4-6 eurobioc2024.bioconductor.or… ! Submit an abstract by April 26 for 🟢 Short talk 🟢 Package demo 🟢 Poster 🟢 Contributed session 👉 Submit here openreview.net/group?id=bioc…
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Dario Righelli retweeted
2024 is 0% complete. #HappyNewYear
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Dario Righelli retweeted
2023 is 100% complete.
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As usual, I forgot to fill the @Bioconductor form for the official #speaker spotlight, so here I am telling you that today (21) at 13:30 I’ll give a short #workshop (45 mins) about Differential Accessible Regions detection in 10xGenomics #multiome #ATAC data. #EuroBioc2023
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Apologies for not sharing the material as a typical #Bioconductor #workshop repo, but data is huge. Anyway, the code and the raw (shorturl.at/quT26) and processed data are publicly available.
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A new @Bioconductor sticker takes place on my laptop! #EuroBioc2023
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Our last work on #SingleCellMultiModal data collection is finally out! 🎉 It has been a long journey 🚀, but it taught me a lot! 🥸 Thanks to all the co-authors (in the comments), I really enjoyed working with all of you! 🤩 doi.org/10.1371/journal.pcbi… (1/5)
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Together with the paper, we released the #Bioconductor #SingleCellMultiModal package, allowing to easily download and handle the collected datasets. Just open your #rstats console and download the data with a single instruction. doi.org/doi:10.18129/B9.bioc… (4/5)

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Thanks again, everyone! It's great to feel part of a friendly and inspiring community like this one! @drisso1893 @LeviWaldron1 @M2RUseR @kelly_thinks #LudwigGeistlinger @RArgelaguet @c_vanderaa @AedinCulhane #LaurentGatto #VincentCarey #MartinMorgan @Bioconductor (5/5)
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Dario Righelli retweeted
2023 is 70% complete.
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Dario Righelli retweeted
Nelle Filippine si è appena scritta una delle pagine più bella nella storia non solo del basket ma dello sport in generale. Il merito è dei due uomini che vedete al centro della foto. A sinistra c'è Manute Bol, il giocatore più alto nella storia della NBA coi suoi 2 metri e 31. Ha giocato tra gli anni 80 e 90. Di etnia dinka, la più alta al mondo, aveva il bisnonno alto 2 metri e 39 sposato con 150 mogli, il padre alto 2 metri 21, la madre 2 metri e 06. Lui coi suoi 2 metri e 31 diventò una attrazione per il pubblico americano. Fino ai 15 anni visse in un villaggio, pascolando mucche, combattendo talvolta con i leoni per difendere i suoi animali, poi, una volta diventato giocatore di basket, iniziò a mantenere tutti i suoi quasi 200 parenti. Ma la sua carriera da giocatore fu seconda solamente a quella di attivista per l'indipendenza del suo paese, il Sud Sudan. Si è stimato che abbia devoluto di tasca sua circa 90 milioni di dollari per costruire strade, ospedali, scuole. A 47 anni è prematuramente morto malato e senza un soldo. Sul punto di morte ha detto che era orgoglioso di aver dato la vita per il suo Paese. A destra c'è Luol Deng, anche lui sudsudanese, 14 stagioni NBA fino al 2019. Iniziò a giocare a basket da bambino in un campo profughi in Egitto dove si rifugiò la sua famiglia. Iniziò a giocare a basket perchè convinto da Manute Bol in persona che aveva aperto varie scuole basket nel continente per avvicinare i bambini al suo sport. Deng ha dichiarato che a Bol deve tutto: la sua carriera, ma soprattutto l'amore per il suo Paese che non ha praticamente potuto vedere per 30 anni a causa della guerra. Manute Bol è morto nel 2010 senza poter assistere al riconoscimento ufficiale dell'indipendenza del Sud Sudan dal Sudan avvenuta nel 2011. Deng ha maturato proprio in quel momento una decisione: creare la federazione basket del suo paese, promuovere la pallacanestro come strumento di emancipazione e come àncora di salvezza per i giovani. E creare la Nazionale di basket. Come sognava Manute. A febbraio la nazionale di basket del Sud Sudan si è qualificata per la prima volta ai Mondiali di basket dopo disputato le prime partite della propria giovanissima storia. Nazionale fondata, presieduta, finanziata e spesso allenata da Luol Deng, che non ha mai giocato una partita in casa in quando il Sud Sudan non ha alcun palasport. Pochi minuti fa, battendo l'Angola, il Sud Sudan ha conquistato il miglior piazzamento di una africana ai mondiali di basket: ciò significa qualificazione alle prossime Olimpiadi di Parigi 2024. Questo miracolo è stato possibile grazie al fatto che nessun giocatore vive nel proprio Paese ma è potuto crescere all'estero grazie alla fuga delle proprie famiglie. Fughe che si sono lasciate dietro storie terribili: molti giocatori sono orfani, alcuni hanno visto il Sud Sudan per la prima volta a febbraio quando diecimila persone li hanno accolti come eroi all'aeroporto, per festeggiare la qualificazione ai Mondiali. Tutti loro sono scesi dall'aereo piangendo. Ma questo miracolo non si sarebbe mai potuto realizzare se due persone straordinarie come Manute Bol e Luol Deng non avessero dato la propria vita per il proprio Paese, scegliendo di utilizzare il basket per sensibilizzare il mondo sulla situazione della loro terra: la più povera e martoriata del pianeta, con la più alta mortalità infantile, dove si vive con 1 euro e 90 al giorno. #MondialiTipo
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